روزنامه جوان گزارش داد: سیدحسن خمینی که در زمان رحلت شیخ یوسف صانعی، دومین سالگرد رحلت امام زمان (عج) را تسلیت گفت، گفت: «یکی از میراث آقای صانعی برای زمان ما، فکری بود. اجتهاد کرد و انتقادی از جمهوری اسلامی دفاع کرد!»
وی «اجتهاد فکری» را از میراث آیت الله صانعی دانست و افزود: دفاع انتقادی از جمهوری اسلامی نیز از دیگر میراث های ایشان بود. دفاع از جمهوری اسلامی به عنوان جنبشی که سالها تلاش و جان فدای آن شد، ضروری است. او به شدت از جمهوری اسلامی دفاع کرد. اگر انحرافی می دیدند نسبت به آن حساس بودند». وی در ادامه درباره رابطه صانعی با جمهوری اسلامی گفت: مثل پدر یا مادری که دلش برای فرزندشان است از آنچه انحراف و نادرست می دیدند تیشه می گرفتند و بیان می کردند.
به نظر می رسد این به معنای دفاع انتقادی از وقایع سال 2008 باشد. صانعی در فتنه 88 از جمهوری اسلامی دفاع نکرد، چه انتقادی و چه مدل دیگری! او در سال 1387 در کنار جنبش سبز قرار گرفت و حمایت اصلاح طلبان به دلیل مواضع سیاسی اوست.
صانعی در مورد نظریه ولایت فقیه نیز تغییر جهت داد و در حالی که در ابتدا معتقد بود «وقتی ولی امر به دعوت دیگران می کند گناه و خلاف شرع است»، بعداً تغییر عقیده داد و اختیار ولی عهد را چنین دانست. «علیه جمهوری و دموکراسی و نوعی استبداد. معلوم نیست بدون نظریه ولایت فقیه چگونه می توان جمهوری اسلامی را جمهوری اسلامی دانست و از آن دفاع انتقادی کرد!